HISTORIAL DE INVESTIGACIÓN

1- Control genético y efectos ambientales sobre el desarrollo. Cronobiología.
2- Fenómica
3- Metabolómica

Sexenios concedidos: 3. Último sexenio: 2013.

MI Terry, F Pérez-Sanz, PJ Navarro, J Weiss, M Egea-Cortines.(2019) The Snapdragon LATE ELONGATED HYPOCOTYL Plays A Dual Role in Activating Floral Growth and Scent Emission. Cells 8 (8), 920

Terry MI, Perez-Sanz F, Díaz-Galián MI, Perez de los Cobos F, Navarro PJ, Egea‐Cortines M, Weiss, J. (2019) The Petunia CHANEL gene is a ZEITLUPE ortholog coordinating growth and scent profiles. Cells 8

Perez-Sanz F, Navarro PJ, Egea-Cortines M (2017). Plant phenomics: an overview of image acquisition technologies and image data analysis algorithms. Gigascience-6: 1–18.

Bombarely, Aureliano; Moser, Michel; Amrad, Avichai, Bao, Manzhu, Bapaume, Laure; Barry, Cornelius; Bliek, Mattijs; Boersma, Maaike; Borghi, Lorenzo; Bruggmann, Rémy; Bucher, Marcel; D'Agostino, Nunzio; Davies, Kevin; Delledonne, Massimo; Druege, Uwe; Dudareva, Natalia; Egea-Cortines, Marcos; Fernandez-Pozo, Noe; Franken, Philipp; Grandont, Laurie; Heslop-Harrison, Pat; Hintzsche, Jennifer; Johns, Mitrick; Koes, Ronald; Lv, Xiaodan; Lyons, Eric; Malla, Diwa; Martinoia, Enrico; Mattson, Neil; Mueller, Lukas; Muhlemann, Joelle; Nouri, Eva; Passeri, Valentina; Pezzotti, Mario; Qi, Qinzhou; Reinhardt, Didier; Rich, Melanie; Richert-Pöggeler, Katja; Robbins, Timothy; Schatz, Michael; Schranz, M; Schuurink, Robert; Schwarzacher, Trude; Spelt, Cornelis; Tang, Haibao; Urbanus, Susan; Vandenbussche, Michiel; Vijverberg, Kitty; Villarino, Gonzalo; Warner, Ryan; Weiss, Julia; Yue, Zhen; Zethof, Jan; Quattrocchio, Francesca, Sims, Thomas, Kuhlemeier, Cris. (2016). Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida. Nature Plants DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.74
http://www.nature.com/articles/nplants201674

Marta Pawluczyk, Julia Weiss, Matthew G. Links, Mikel Egaña Aranguren, Mark D. Wilkinson, Marcos Egea-Cortines. (2015) Quantitative evaluation of bias in PCR amplification and Next Generation Sequencing derived from metabarcoding samples. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 407:1841-1848

MI Terry, F Pérez-Sanz, PJ Navarro, J Weiss, M Egea-Cortines. The Snapdragon LATE ELONGATED HYPOCOTYL Plays A Dual Role in Activating Floral Growth and Scent Emission. Cells 8 (8), 920 2019.
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M Carvalho, I Castro, J Moutinho-Pereira, C Correia, M Egea-Cortines. Evaluating stress responses in cowpea under drought stress. Journal of Plant Physiology, 153001 2019.
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MI Terry, M Carrera-Alesina, J Weiss, M Egea-Cortines. Molecular and transcriptional structure of the petal and leaf circadian clock in Petunia hybrida. BioRxiv.
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Terry MI, Perez-Sanz F, Díaz-Galián MI, Perez de los Cobos F, Navarro PJ, Egea‐Cortines M, Weiss, J. (2019) The Petunia CHANEL gene is a ZEITLUPE ortholog coordinating growth and scent profiles. Cells 8.

M. Martos-Fuentes, C. Egea-Gilabert, I. Mezaka, J.A. Fernández, M. Egea-Cortines, J. Weiss. (2019). Distance analysis among northern and southern European legume accessions using next-generation sequencing reveal discrepancies between geographic and genetic origins, Scientia Horticulturae, Volume 243, Pages 498-505.
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2018

Victoria Ruiz-Hernández, María José Roca, Marcos Egea-Cortines and Julia Weiss. (2018). A comparison of semi-quantitative methods suitable for establishing volatile profiles. Plant Methods. 14:67

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Egea-Cortines, Marcos and John Doonan. (2018). Phenomics. Frontiers in Plant Sciences.
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Julia Weiss, Marta I. Terry, Marina Martos-Fuentes, Lisa Letourneux, Victoria Ruiz-Hernández, Juan A. Fernández and Marcos Egea-Cortines (2018). Diel pattern of circadian clock and storage protein gene expression in leaves and during seed filling in cowpea (Vigna unguiculata). BMC Plant Biology. 18: 33-53.
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Georgia Ntatsi, Marcos Egea Gutiérrez-Cortines, Ioannis, Karapanos, Ana Barros, Julia Weiss, Astrit Balliu, Eduardo Augusto dos Santos Rosa, Dimitrios Savvas (2018). The quality of leguminous vegetables as influenced by pre-harvest factors. Scientia Horticulturae. 232: 191-205.
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2017

Carvalho Marcia, María Muñoz-Amatriaín, Isaura Castro, Teresa Lino-Neto, Manuela Matos, Marcos Egea-Cortines, Eduardo Rosa, Timothy Close, Valdemar Carnide (2017). Comparison of genetic diversity of Iberian Peninsula cowpeas with worlwide landraces using high density SNP markers. BMC Genomics 18:891.
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Perez-Sanz F, Navarro PJ, Egea-Cortines M (2017). Plant phenomics: an overview of image acquisition technologies and image data analysis algorithms. Gigascience-6: 1–18.
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Ruiz-Hernández, V., Hermans, B., Weiss, J. and Egea-Cortines, M. (2017). Genetic analysis of natural variation in Antirrhinum scent profiles identifies BENZOIC ACID CARBOXYMETHYL TRANSFERASE as the major locus controlling methyl benzoate synthesis, Frontiers in plant science 8, 27–40.
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2016

Weiss, J., Mühlemann, J. K., Ruiz-Hernández, V., Dudareva, N. and Egea-Cortines, M. (2016). 'Phenotypic space and variation of floral scent profiles during late flower development in Antirrhinum', Frontiers in plant science, 7: 1903.

Weiss, J., T. Alcantud-Rodriguez, Raquel Toksöz, and M. Egea-Cortines (2016). Meristem maintenance, auxin, jasmonic and abscisic acid pathways as a mechanism for phenotypic plasticity in Antirrhinum majus. Scientific Reports 6:19807.

Navarro, P. J., Pérez, F., Weiss, J., and Egea-Cortines, M. (2016). Machine learning and computer vision system for phenotype data acquisition and analysis in plants. Sensors (Basel). 16:641.

Bombarely, Aureliano; Moser, Michel; Amrad, Avichai, Bao, Manzhu, Bapaume, Laure; Barry, Cornelius; Bliek, Mattijs; Boersma, Maaike; Borghi, Lorenzo; Bruggmann, Rémy; Bucher, Marcel; D'Agostino, Nunzio; Davies, Kevin; Delledonne, Massimo; Druege, Uwe; Dudareva, Natalia; Egea-Cortines, Marcos; Fernandez-Pozo, Noe; Franken, Philipp; Grandont, Laurie; Heslop-Harrison, Pat; Hintzsche, Jennifer; Johns, Mitrick; Koes, Ronald; Lv, Xiaodan; Lyons, Eric; Malla, Diwa; Martinoia, Enrico; Mattson, Neil; Mueller, Lukas; Muhlemann, Joelle; Nouri, Eva; Passeri, Valentina; Pezzotti, Mario; Qi, Qinzhou; Reinhardt, Didier; Rich, Melanie; Richert-Pöggeler, Katja; Robbins, Timothy; Schatz, Michael; Schranz, M; Schuurink, Robert; Schwarzacher, Trude; Spelt, Cornelis; Tang, Haibao; Urbanus, Susan; Vandenbussche, Michiel; Vijverberg, Kitty; Villarino, Gonzalo; Warner, Ryan; Weiss, Julia; Yue, Zhen; Zethof, Jan; Quattrocchio, Francesca, Sims, Thomas, Kuhlemeier, Cris. (2016). Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida. Nature Plants DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.74
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2015

Marta Pawluczyk, Julia Weiss, Matthew G. Links, Mikel Egaña Aranguren, Mark D. Wilkinson, Marcos Egea-Cortines. (2015). Quantitative evaluation of bias in PCR amplification and Next Generation Sequencing derived from metabarcoding samples. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 407:1841-1848.

2014

Manchado-Rojo, M., Weiss, J. and Egea-Cortines, M. (2014). Validation of Aintegumenta as a gene to modify floral size in ornamental plants. Plant Biotechnolology Journal 12(8):1053–1065.

Ruiz-Ramon F, Águila, D, Egea-Cortines, M and Weiss, J (2014). Optimization of fragrance extraction: daytime and flower age affect scent emission in simple and double narcissi. Industrial Crops and Products. 52, 671–78.

2013

Egea-Cortines Marcos & Weiss, J. (2013). Control of plant organ size. eLS. Wiley.

Egea-Cortines M, Ruíz-Ramón F, Weiss J. (2013). Circadian Regulation of Horticultural Traits: Integration of Environmental Signals in Plants In: Janick J, ed. Horticultural Reviews, Vol. 41: Wiley. Chapter 2

2012

Navarro PJ, Fernández C, Weiss J, Egea-Cortines M. (2012). Development of a configurable growth chamber with a vision system to study circadian rhythm in plants. Sensors 12, 15356-15375.

Antolinos, V., Fernández, P.S., Ros-Chumillas, M., Periago, P.M., and Weiss, J. (2012). Development of a High-Resolution Melting- Based Approach for Efficient Differentiation Among Bacillus cereus Group Isolates. Foodborne Pathogens and Disease. 9(9): 777-785

Manchado-Rojo, M., Delgado-Benarroch. L,. Roca, MJ., Weiss, J and Egea-Cortines M. (2012). Quantitative requirements of Deficiens and Globosa for late petal development show a complex transcriptional network topology of B function. Plant Journal. 72:294-307.

Weiss, J., Mallona, I., Gomez-di-Marco, P., Fernández-Valera, J.M., and Egea-Cortines, M. (2012). Genotyping Antirrhinum commercial varieties using miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs). Scientia Horticulturae. 144:161-167.

Pawluczyk, Marta., Weiss, Julia., Vicente, Mar_a Jos_ and Egea-Cortines, Marcos (2012). Two alleles of rpoB and rpoC1 distinguish an endemic European population from Cistus heterophyllus and its putative hybrid (C. x clausonis) with C. albidus. Plant Systematic and Evolution. 298: 409-419

2011

Mallona, Izaskun.,Julia Weiss and Egea-Cortines, Marcos (2011). pcrEfficiency: A Web tool for PCR amplification efficiency prediction. BMC Bioinformatics.12: 404

Mallona, Izaskun., Egea-Cortines, Marcos and Julia Weiss. (2011). Conserved and divergent expression rhythms of CAM related- and core clock genes in the Cactus Opuntia ficus-indica. Plant Physiology. 156:1978-1989

2010

Schwarz-Sommer, Zsuzsanna., Thomas Gübitz., Julia Weiss., Perla Gómez di-Marco., Luciana Delgado Benarroch., Andrew Hudson and Marcos Egea-Cortines. (2010). A molecular recombination map of Antirrhinum majus. BMC Plant Biology.10: 275

Delgado-Benarroch, L., Weiss, J and Egea-Cortines. (2010). Sizing up the flower. In : The Flowering Process and its Control in Plants: Gene Expression and Hormone Interaction. Editors: M. Yaish and J. Colasanti. pp-199-216. ISBN-978-81-308-0436-1

Gómez di Marco P., Pagnon M., Egea-Cortines M., Artes F., Weiss J. (2010). A fast molecular non-destructive protocol for evaluating aerobic bacterial load on fresh-cut lettuce. Food Science and Technology International. 16: 409-15

Doménech-Peris, Asunción., Conesa-Zamora, Pablo., Sahuquillo-Frias Laura., Ortiz-Reina, Sebastián., Moya-Biosca, Joaquín., Acosta-Ortega, Jesús., Pérez-Guillermo, Miguel., Egea-Cortines, Marcos., (2010). HPV genotyping in histologic sections of precursor lesions of cervical carcinoma: Its role as a possible adjunct for the evaluation of the oncogenic potential of specific HPV genotypes. A study in a coastal region of southeast Spain. Gynecologic and Obstetric Investigation. 70:113-119

Izaskun Mallona, Sandra Lischewski, Julia Weiss, Bettina Hause and Marcos Egea-Cortines (2010). Validation of endogenous genes as controls for quantitative real-time PCR during leaf and flower development in Petunia hybrida. BMC Plant Biology.10: 4

Project- PROYECTO BFU-2017 88300-C2-1-R. Análisis de genes de control del desarrollo floral y la emisión de volátiles. Desarrollo de fenotipado automático mediante visión artificial basado en máquinas de aprendizaje.
 

Project- Diverfarming H2020- 2017-2022

Project- CDTI- Artificial vision and plant development-2017-2019

Project- MELOMUR-RIS3 2018-2022

Project- 19398/PI/14 Fundación Séneca- DETERMINACIÓN DEL CONTROL DE LA EMISIÓN DE VOLÁTILES FLORALES POR EL BUCLE NOCTURNO DEL RELOJ CIRCADIANO EN PETUNIA

Proyecto MCINN-FEDER. BFU2010-15843. Analisis genético de rutas biológicas y señales ambientales involucradas en el control de tamaño floral y caracteres de inflorescencia.

Proyecto MEC. AGL2007-61384. Mejora del tamaño floral en Antirrhinum majus por técnicas de genética inversa. 2007-9. Investigador principal: Dr. Marcos Egea Gutierrez-Cortines. Grupo: Dra Julia Weiss, Lic. Luciana Delgado Benarroch, María Manchado Rojo, Izaskun Mallona González.

Proyecto Fundación Séneca. 11895/PI/09. Identificación de genes de interés agronómico para la mejora de flor en Petunia hybrida mediante técnicas de genética inversa. Investigador principal: Prof. Dr. Julia Weiss. Investigadores: Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines, Ing. María Manchado Rojo, Lic. Izaskun Mallona González.

Project -PR2010-0591-Effect of circadian clock genes on scent emission in Antirrhinum. Ministerio de Educación. UPCT-Purdue University.
Researchers Marcos Egea Gutiérrez-Cortines (UPCT) Natalia Dudareva (Purdue University, USA)

Luciana Delgado Benarroch. Control genético del tamaño floral en Antirrhinum. Julio 2008. Sobresaliente cum laude.

Asunción Domenech Peris. Estudio molecular e inmunohistoquímico de lesiones precursoras de cáncer de cuello de útero. Abril 2010. Sobresaliente cum laude.

Izaskun Mallona González. Identication of novel genes involved in Petunia flower development using transcript proling and reverse genetics. Julio 2012. Sobresaliente Cum Laude

María Manchado Rojo. (18 diciembre 2015). Desarrollo de herramientas de genómica inversa para mejora de ornamentales. Dr. Marcos Egea-Cortines y Dr. Julia Weiss. Sobresaliente Cum Laude

 Título del trabajo: Role of plastid markers in environmental studies on the example of the endangered species
Cistus heterophyllus
Tipo de proyecto: Tesis Doctoral
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Marta Pawluckzuk
Fecha de defensa: 05/05/2017
Mención de calidad: Si

Título del trabajo: GENETIC STRUCTURE OF SCENT PROFILES IN ANTIRRHINUM. IMPLICATIONS FOR THE EVOLUTION AND INTERACTION WITH PESTS AND POLLINATORS

Doctoranda: Maria Victoria Ruíz Hernández

Fecha de defensa: 11 de octubre 2018

Tesis con mención Internacional.

Calificación: Sobresaliente cum Laude

Título de la tesis:

Doctorando: Fernando Perez Sanz

Izaskun Mallona González. Selección de genes de normalización para RT-PCR cuantitativa en Petunia hybrida. Septiembre 2008. Premio Extraordinario de Master.

Marta Sánchez Hernández. Genotipos del HPV en el carcinoma escamoso in situ de la piel. Octubre 2009.

Fabiola Ruíz Ramón. Análisis de alelismo del locus nana de A. Majus con los genes Early Flowering 3 y Late elongated hypocotyl. Julio 2012.

Raquel Alcantud Rodríguez. INTEGRACIÓN DIVERGENTE DE SEÑALES MEDIAMBIENTALES  (HACINAMIENTO Y DEFOLIACIÓN ) EN EL MERISTEMO APICAL. Julio 2012

Victoria Ruiz Hernández. Análisis genético de la emisión de volátiles en una población de A.majus x A.linkianum

Luisa María Carrión DETERMINACIÓN DE MÉTODOS DE EXTRACCIÓN Y USO DE BIOPOLIMEROS DE Opuntia ficus – indica (2015)

Jaime Molina Ballesteros. Análisis fenotípico de una población segregante de líneas de silenciamiento génico del gen LHY en Antirrhinum.majus (2015)

Título del trabajo: EVALUACIÓN DE LA CLASIFICACIÓN TAXONÓMICA DE MUESTRAS AMBIENTALES POR
MÉTODOS BASADOS EN ASIGNACIÓN POR K-MERS
Tipo de proyecto: TF-Master
Entidad de realización: Universidad de Murcia
Alumno/a: Borja Rojas Panadero
Fecha de defensa: 13/09/2018
3 Título del trabajo: Evaluación de protocolos basados en eliminación de ruido aplicados en metagenómica dirigida
Tipo de proyecto: TF-Master
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Felipe Perez de los Cobos Arnao
Fecha de defensa: 13/09/2018
4 Título del trabajo: ASCERTAINING THE PCR CONDITIONS AND DIEL EXPRESSION PROFILE OF DROUGHT
RELATED GENES USING GENOMIC DNA AND cDNA FROM COWPEA (Vigna unguiculata L. Walp.) LEAVES
Tipo de proyecto: TF-Master
Codirector/a tesis: Julia Weiss
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Murat Atun
Fecha de defensa: 25/07/2018
5 Título del trabajo: RELATIVE EXPRESSION RATES OF miRNAs IN PETALS OF PETUNIA HYBRIDA DURING
THE DAY/NIGHT THROUGH NEXT-GENERATION SEQUENCING
Tipo de proyecto: Trabajo fin de Master

Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Onurçan Özbollat
Calificación obtenida: 9,5
Fecha de defensa: 26/09/2017
6 Título del trabajo: Determinación de alelos hipomórficos de ocimeno sintasa en Antirrhinum
Tipo de proyecto: Trabajo fin de Master
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Maria del Carmen López Guerrero
Calificación obtenida: 9,5
Fecha de defensa: 20/09/2017
7 Título del trabajo: Desarrollo de scripts para el fenotipado mediante visión artificial de movimiento y crecimiento
vegetal
Tipo de proyecto: Trabajo fin de Master
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Maria Victoria Díaz Galian
Fecha de defensa: 11/07/2017

Título del trabajo: Estructura molecular de los transcriptomas de intervención rápida
Tipo de proyecto: Trabajo fin de master
Entidad de realización: Universidad de Murcia Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: David Tomás García
Fecha de defensa: 12/09/2016
10 Título del trabajo: Segmentado de imágenes de fenotipado de alta resolución
Tipo de proyecto: Trabajo fin de Master
Entidad de realización: Universidad de Murcia Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Cornelio Díaz Tristan
Fecha de defensa: 11/09/2016
11 Título del trabajo: Identificación y caracterización de los transcritos de los genes PhGi1 y PhGi2 en Petunia x
hybrida.
Entidad de realización: Universidad de Murcia Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Marta Carrera Alesina
Fecha de defensa: 09/2016

Herramientas de genómica en investigación.