HISTORIAL DE INVESTIGACIÓN

ÁREA DE INVESTIGACIÓN

Apellidos, Nombre:  Egea Gutiérrez-Cortines, Marcos.

Categoría:  Catedrático de Universidad.

Área: Genética

Departamento: Ciencia y Tecnología Agraria

Breve descripción investigación

1- Control genético y efectos ambientales sobre el desarrollo. Cronobiología.
2- Fenómica
3- Metabolómica


SEXENIOS CONCEDIDOS

Sexenios concedidos: 3. Último sexenio: 2013.

PUBLICACIONES DESTACADAS


Perez-Sanz F, Navarro PJ, Egea-Cortines M (2017). Plant phenomics: an overview of image acquisition technologies and image data analysis algorithms. Gigascience-6: 1–18.

Weiss, J., T. Alcantud-Rodriguez, Raquel Toksöz, and M. Egea-Cortines (2016) Meristem maintenance, auxin, jasmonic and abscisic acid pathways as a mechanism for phenotypic plasticity in Antirrhinum majus. Scientific Reports 6:19807.

Navarro, P. J., Pérez, F., Weiss, J., and Egea-Cortines, M. (2016). Machine learning and computer vision system for phenotype data acquisition and analysis in plants. Sensors (Basel). 16:641

Bombarely, Aureliano; Moser, Michel; Amrad, Avichai, Bao, Manzhu, Bapaume, Laure; Barry, Cornelius; Bliek, Mattijs; Boersma, Maaike; Borghi, Lorenzo; Bruggmann, Rémy; Bucher, Marcel; D'Agostino, Nunzio; Davies, Kevin; Delledonne, Massimo; Druege, Uwe; Dudareva, Natalia; Egea-Cortines, Marcos; Fernandez-Pozo, Noe; Franken, Philipp; Grandont, Laurie; Heslop-Harrison, Pat; Hintzsche, Jennifer; Johns, Mitrick; Koes, Ronald; Lv, Xiaodan; Lyons, Eric; Malla, Diwa; Martinoia, Enrico; Mattson, Neil; Mueller, Lukas; Muhlemann, Joelle; Nouri, Eva; Passeri, Valentina; Pezzotti, Mario; Qi, Qinzhou; Reinhardt, Didier; Rich, Melanie; Richert-Pöggeler, Katja; Robbins, Timothy; Schatz, Michael; Schranz, M; Schuurink, Robert; Schwarzacher, Trude; Spelt, Cornelis; Tang, Haibao; Urbanus, Susan; Vandenbussche, Michiel; Vijverberg, Kitty; Villarino, Gonzalo; Warner, Ryan; Weiss, Julia; Yue, Zhen; Zethof, Jan; Quattrocchio, Francesca, Sims, Thomas, Kuhlemeier, Cris. (2016). Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida. Nature Plants DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.74
http://www.nature.com/articles/nplants201674

 

Marta Pawluczyk, Julia Weiss, Matthew G. Links, Mikel Egaña Aranguren, Mark D. Wilkinson, Marcos Egea-Cortines. (2015) Quantitative evaluation of bias in PCR amplification and Next Generation Sequencing derived from metabarcoding samples. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 407:1841-1848

 

 

 

Otras Publicaciones


M. Martos-Fuentes, C. Egea-Gilabert, I. Mezaka, J.A. Fernández, M. Egea-Cortines, J. Weiss. (2019). Distance analysis among northern and southern European legume accessions using next-generation sequencing reveal discrepancies between geographic and genetic origins, Scientia Horticulturae, Volume 243, Pages 498-505.
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2018

Victoria Ruiz-Hernández, María José Roca, Marcos Egea-Cortines and Julia Weiss. (2018). A comparison of semi-quantitative methods suitable for establishing volatile profiles. Plant Methods. 14:67

Link

Egea-Cortines, Marcos and John Doonan. (2018). Phenomics. Frontiers in Plant Sciences.
Link

Julia Weiss, Marta I. Terry, Marina Martos-Fuentes, Lisa Letourneux, Victoria Ruiz-Hernández, Juan A. Fernández and Marcos Egea-Cortines (2018). Diel pattern of circadian clock and storage protein gene expression in leaves and during seed filling in cowpea (Vigna unguiculata). BMC Plant Biology. 18: 33-53.
Link

Georgia Ntatsi, Marcos Egea Gutiérrez-Cortines, Ioannis, Karapanos, Ana Barros, Julia Weiss, Astrit Balliu, Eduardo Augusto dos Santos Rosa, Dimitrios Savvas (2018). The quality of leguminous vegetables as influenced by pre-harvest factors. Scientia Horticulturae. 232: 191-205.
Link

2017

Carvalho Marcia, María Muñoz-Amatriaín, Isaura Castro, Teresa Lino-Neto, Manuela Matos, Marcos Egea-Cortines, Eduardo Rosa, Timothy Close, Valdemar Carnide (2017). Comparison of genetic diversity of Iberian Peninsula cowpeas with worlwide landraces using high density SNP markers. BMC Genomics 18:891.
Link

Perez-Sanz F, Navarro PJ, Egea-Cortines M (2017). Plant phenomics: an overview of image acquisition technologies and image data analysis algorithms. Gigascience-6: 1–18.
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Ruiz-Hernández, V., Hermans, B., Weiss, J. and Egea-Cortines, M. (2017). Genetic analysis of natural variation in Antirrhinum scent profiles identifies BENZOIC ACID CARBOXYMETHYL TRANSFERASE as the major locus controlling methyl benzoate synthesis, Frontiers in plant science 8, 27–40.
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2016

Weiss, J., Mühlemann, J. K., Ruiz-Hernández, V., Dudareva, N. and Egea-Cortines, M. (2016). 'Phenotypic space and variation of floral scent profiles during late flower development in Antirrhinum', Frontiers in plant science, 7: 1903.

Weiss, J., T. Alcantud-Rodriguez, Raquel Toksöz, and M. Egea-Cortines (2016). Meristem maintenance, auxin, jasmonic and abscisic acid pathways as a mechanism for phenotypic plasticity in Antirrhinum majus. Scientific Reports 6:19807.

Navarro, P. J., Pérez, F., Weiss, J., and Egea-Cortines, M. (2016). Machine learning and computer vision system for phenotype data acquisition and analysis in plants. Sensors (Basel). 16:641.

Bombarely, Aureliano; Moser, Michel; Amrad, Avichai, Bao, Manzhu, Bapaume, Laure; Barry, Cornelius; Bliek, Mattijs; Boersma, Maaike; Borghi, Lorenzo; Bruggmann, Rémy; Bucher, Marcel; D'Agostino, Nunzio; Davies, Kevin; Delledonne, Massimo; Druege, Uwe; Dudareva, Natalia; Egea-Cortines, Marcos; Fernandez-Pozo, Noe; Franken, Philipp; Grandont, Laurie; Heslop-Harrison, Pat; Hintzsche, Jennifer; Johns, Mitrick; Koes, Ronald; Lv, Xiaodan; Lyons, Eric; Malla, Diwa; Martinoia, Enrico; Mattson, Neil; Mueller, Lukas; Muhlemann, Joelle; Nouri, Eva; Passeri, Valentina; Pezzotti, Mario; Qi, Qinzhou; Reinhardt, Didier; Rich, Melanie; Richert-Pöggeler, Katja; Robbins, Timothy; Schatz, Michael; Schranz, M; Schuurink, Robert; Schwarzacher, Trude; Spelt, Cornelis; Tang, Haibao; Urbanus, Susan; Vandenbussche, Michiel; Vijverberg, Kitty; Villarino, Gonzalo; Warner, Ryan; Weiss, Julia; Yue, Zhen; Zethof, Jan; Quattrocchio, Francesca, Sims, Thomas, Kuhlemeier, Cris. (2016). Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida. Nature Plants DOI: 10.1038/NPLANTS.2016.74
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2015

Marta Pawluczyk, Julia Weiss, Matthew G. Links, Mikel Egaña Aranguren, Mark D. Wilkinson, Marcos Egea-Cortines. (2015). Quantitative evaluation of bias in PCR amplification and Next Generation Sequencing derived from metabarcoding samples. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 407:1841-1848.

2014

Manchado-Rojo, M., Weiss, J. and Egea-Cortines, M. (2014). Validation of Aintegumenta as a gene to modify floral size in ornamental plants. Plant Biotechnolology Journal 12(8):1053–1065.

Ruiz-Ramon F, Águila, D, Egea-Cortines, M and Weiss, J (2014). Optimization of fragrance extraction: daytime and flower age affect scent emission in simple and double narcissi. Industrial Crops and Products. 52, 671–78.

2013

Egea-Cortines Marcos & Weiss, J. (2013). Control of plant organ size. eLS. Wiley.

Egea-Cortines M, Ruíz-Ramón F, Weiss J. (2013). Circadian Regulation of Horticultural Traits: Integration of Environmental Signals in Plants In: Janick J, ed. Horticultural Reviews, Vol. 41: Wiley. Chapter 2

2012

Navarro PJ, Fernández C, Weiss J, Egea-Cortines M. (2012). Development of a configurable growth chamber with a vision system to study circadian rhythm in plants. Sensors 12, 15356-15375.

Antolinos, V., Fernández, P.S., Ros-Chumillas, M., Periago, P.M., and Weiss, J. (2012). Development of a High-Resolution Melting- Based Approach for Efficient Differentiation Among Bacillus cereus Group Isolates. Foodborne Pathogens and Disease. 9(9): 777-785

Manchado-Rojo, M., Delgado-Benarroch. L,. Roca, MJ., Weiss, J and Egea-Cortines M. (2012). Quantitative requirements of Deficiens and Globosa for late petal development show a complex transcriptional network topology of B function. Plant Journal. 72:294-307.

Weiss, J., Mallona, I., Gomez-di-Marco, P., Fernández-Valera, J.M., and Egea-Cortines, M. (2012). Genotyping Antirrhinum commercial varieties using miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs). Scientia Horticulturae. 144:161-167.

Pawluczyk, Marta., Weiss, Julia., Vicente, Mar_a Jos_ and Egea-Cortines, Marcos (2012). Two alleles of rpoB and rpoC1 distinguish an endemic European population from Cistus heterophyllus and its putative hybrid (C. x clausonis) with C. albidus. Plant Systematic and Evolution. 298: 409-419

2011

Mallona, Izaskun.,Julia Weiss and Egea-Cortines, Marcos (2011). pcrEfficiency: A Web tool for PCR amplification efficiency prediction. BMC Bioinformatics.12: 404

Mallona, Izaskun., Egea-Cortines, Marcos and Julia Weiss. (2011). Conserved and divergent expression rhythms of CAM related- and core clock genes in the Cactus Opuntia ficus-indica. Plant Physiology. 156:1978-1989

2010

Schwarz-Sommer, Zsuzsanna., Thomas Gübitz., Julia Weiss., Perla Gómez di-Marco., Luciana Delgado Benarroch., Andrew Hudson and Marcos Egea-Cortines. (2010). A molecular recombination map of Antirrhinum majus. BMC Plant Biology.10: 275

Delgado-Benarroch, L., Weiss, J and Egea-Cortines. (2010). Sizing up the flower. In : The Flowering Process and its Control in Plants: Gene Expression and Hormone Interaction. Editors: M. Yaish and J. Colasanti. pp-199-216. ISBN-978-81-308-0436-1

Gómez di Marco P., Pagnon M., Egea-Cortines M., Artes F., Weiss J. (2010). A fast molecular non-destructive protocol for evaluating aerobic bacterial load on fresh-cut lettuce. Food Science and Technology International. 16: 409-15

Doménech-Peris, Asunción., Conesa-Zamora, Pablo., Sahuquillo-Frias Laura., Ortiz-Reina, Sebastián., Moya-Biosca, Joaquín., Acosta-Ortega, Jesús., Pérez-Guillermo, Miguel., Egea-Cortines, Marcos., (2010). HPV genotyping in histologic sections of precursor lesions of cervical carcinoma: Its role as a possible adjunct for the evaluation of the oncogenic potential of specific HPV genotypes. A study in a coastal region of southeast Spain. Gynecologic and Obstetric Investigation. 70:113-119

Izaskun Mallona, Sandra Lischewski, Julia Weiss, Bettina Hause and Marcos Egea-Cortines (2010). Validation of endogenous genes as controls for quantitative real-time PCR during leaf and flower development in Petunia hybrida. BMC Plant Biology.10: 4

PROYECTO DE INVESTIGACIÓN DESTACADO


Project- 19398/PI/14 Fundación Séneca- DETERMINACIÓN DEL CONTROL DE LA EMISIÓN DE VOLÁTILES FLORALES POR EL BUCLE NOCTURNO DEL RELOJ CIRCADIANO EN PETUNIA

 

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN


Proyecto MCINN-FEDER. BFU2010-15843. Analisis genético de rutas biológicas y señales ambientales involucradas en el control de tamaño floral y caracteres de inflorescencia.

Proyecto MEC. AGL2007-61384. Mejora del tamaño floral en Antirrhinum majus por técnicas de genética inversa. 2007-9. Investigador principal: Dr. Marcos Egea Gutierrez-Cortines. Grupo: Dra Julia Weiss, Lic. Luciana Delgado Benarroch, María Manchado Rojo, Izaskun Mallona González.

Proyecto Fundación Séneca. 11895/PI/09. Identificación de genes de interés agronómico para la mejora de flor en Petunia hybrida mediante técnicas de genética inversa. Investigador principal: Prof. Dr. Julia Weiss. Investigadores: Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines, Ing. María Manchado Rojo, Lic. Izaskun Mallona González.

Project -PR2010-0591-Effect of circadian clock genes on scent emission in Antirrhinum. Ministerio de Educación. UPCT-Purdue University.
Researchers Marcos Egea Gutiérrez-Cortines (UPCT) Natalia Dudareva (Purdue University, USA)

 

TESIS DOCTORALES DIRIGIDAS


Luciana Delgado Benarroch. Control genético del tamaño floral en Antirrhinum. Julio 2008. Sobresaliente cum laude.

Asunción Domenech Peris. Estudio molecular e inmunohistoquímico de lesiones precursoras de cáncer de cuello de útero. Abril 2010. Sobresaliente cum laude.

Izaskun Mallona González. Identi cation of novel genes involved in Petunia flower development using transcript pro ling and reverse genetics. Julio 2012. Sobresaliente Cum Laude

María Manchado Rojo. (18 diciembre 2015). Desarrollo de herramientas de genómica inversa para mejora de ornamentales. Dr. Marcos Egea-Cortines y Dr. Julia Weiss. Sobresaliente Cum Laude

 Título del trabajo: Role of plastid markers in environmental studies on the example of the endangered species
Cistus heterophyllus
Tipo de proyecto: Tesis Doctoral
Entidad de realización: Universidad Politécnica de
Cartagena
Tipo de entidad: Universidad
Alumno/a: Marta Pawluckzuk
Fecha de defensa: 05/05/2017
Mención de calidad: Si

Título del trabajo: GENETIC STRUCTURE OF SCENT PROFILES IN ANTIRRHINUM. IMPLICATIONS FOR THE EVOLUTION AND INTERACTION WITH PESTS AND POLLINATORS

Doctoranda: Maria Victoria Ruíz Hernández

Fecha de defensa: 11 de octubre 2018

Tesis con mención Internacional.

Calificación: Sobresaliente cum Laude

TRABAJOS FIN DE MÁSTER


Izaskun Mallona González. Selección de genes de normalización para RT-PCR cuantitativa en Petunia hybrida. Septiembre 2008. Premio Extraordinario de Master.

Marta Sánchez Hernández. Genotipos del HPV en el carcinoma escamoso in situ de la piel. Octubre 2009.

Fabiola Ruíz Ramón. Análisis de alelismo del locus nana de A. Majus con los genes Early Flowering 3 y Late elongated hypocotyl. Julio 2012.

Raquel Alcantud Rodríguez. INTEGRACIÓN DIVERGENTE DE SEÑALES MEDIAMBIENTALES  (HACINAMIENTO Y DEFOLIACIÓN ) EN EL MERISTEMO APICAL. Julio 2012

Victoria Ruiz Hernández. Análisis genético de la emisión de volátiles en una población de A.majus x A.linkianum

 

Luisa María Carrión DETERMINACIÓN DE MÉTODOS DE EXTRACCIÓN Y USO DE BIOPOLIMEROS DE Opuntia ficus – indica (2015)

Jaime Molina Ballesteros. Análisis fenotípico de una población segregante de líneas de silenciamiento génico del gen LHY en Antirrhinum.majus (2015)

 

 

DOCENCIA EN EL MÁSTER


Herramientas de genómica en investigación.

Nº DE PUBLICACIONES ISI


Nº de publicaciones: 40.Índice H: 16.

DATOS DE CONTACTO

Egea Gutiérrez-Cortines, Marcos
Despacho: Laboratorio de investigación-3ª planta edificio I+D+i. Despacho tutorias 2ª planta Alfonso XIII 48
Marcos
(+34) 868 071 075
Última modificación: 5 de noviembre del 2018.

Coordinador: Dr. Francisco Artés Hernández
E-mail: fr.artes-hdez@upct.es
Teléfono: (+34) 968 32 55 09
© Universidad Politécnica de Cartagena
Paseo Alfonso XIII 48. 30203 Cartagena

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